原子能機構的決策機關對原子能機構的計劃和預算做出決定。它們包括由全體成員國組成的大會和由35名成員組成的理事會。大會每年都在原子能機構總部維也納召開會議，通常在9月舉行。理事會每年召開五次會議，同樣在維也納舉行。
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