Бюро проводит объективную, независимую и систематическую оценку и помогает МАГАТЭ эффективно и результативно осуществлять свой мандат, обеспечивать подотчетность и добросовестное управление. Оно регулярно проводит аудит и оценку программ, деятельности и процедур Агентства.
Бюро также проводит расследования в случае обнаружения признаков мошенничества, коррупции и неправомерного поведения и устанавливает, были ли совершены противоправные действия. Кроме того, Бюро по запросу оказывает консультационные услуги старшим должностным лицам и руководителям программ, чем содействует постоянному улучшению показателей исполнения программ МАГАТЭ. Бюро подчиняется непосредственно Генеральному директору, что гарантирует его независимость и объективность. О результатах своей работы Бюро ежегодно отчитывается перед государствами-членами и Советом управляющих.